Quiero saber porque a mi esposa la deportaron en chile

Entiendo tu molestia, no estoy de acuerdo a veces en el proceder.
Para responder tu pregunta abria que saber mas detalles.
Por lo que no te puedo responder pero hablare en general.

El Reglamento de Extranjeria permite que un extranjero puede estar en calidad de turistas hasta un maximo de 90 dias consecutivos, mas sin embargo no implica que a todos se les otorguen los 90 dias.
Hay dos procedimiento similares uno es el rechazo, es decir no se te permite entrar a chile
el otro es la deportación en algunos casos se hace via tribunales aunque para la copa america se habilito la deportacion automatica si los extranjeros hacian desastres o desordenes públicos.
Lamento tu situacion